影响 DMFCs的性能的主要因素有；（a）膜厚度，（b）电池温度，（c）甲醇浓度，（d）燃料的 pH 值，（e）催化剂活性，（f）电极结构，（g）甲醇渗透燃料的利用率低，在阴极形成混合电位和（h）阴极扩散层的聚偏氟乙烯（PTFE）的含量。其中，催化剂活性低是影响 DMFC 性能最为关键的因素。
原因有：（1）电催化剂活性低，导致化学反应速率降低；（2）Pt 易吸附甲醇氧化的含氧活性中间体 COx 导致催化剂中毒；（3）Pt 等金属价格昂贵；（4）低温条件下运行时，在阳极会产生高过电位，降低转换效率；考虑到以上这些关键因素，研究者们现在致力于发展耐久性好，价格低廉，并且有较高活性和稳定性的阳极甲醇氧化（MOR）和阴极氧气还原（ORR）催化剂。
采取得主要途径有：（1）通过 Pt 与其它贵金属形成合金降低 Pt 用量；（2）制备不同形貌的低铂催化剂，提高催化剂活性；（3）寻找非贵金属或非金属催化剂。
