电生功能水特殊的理化性质决定了其特殊的特点，主要可概括为：
由于自然界中存在的病原菌种类繁多，一般用一种药剂难以对各类有害微生物都起到令人满意的灭菌效果。对强酸性离子水的研究结果证明：强酸性离子水具有很强的杀菌效力，且适用范围广，对于各类微生物均具有非常强的杀灭作用，其杀菌效果明显优于臭氧、次氯酸钠等传统杀菌剂。可在短时间内杀灭各种细菌如金黄色葡萄球菌、绿浓杆菌、大肠杆菌、沙门氏菌等，各种霉菌如毛霉、青霉、曲霉等以及肠道病毒、流感病毒等各类微生物。
用强酸性离子水处理30 min可杀灭细菌芽胞，还可在30 s内使乙肝病毒表面抗原灭活。
电生功能水与传统的化学消毒、杀菌药剂有很大的不同，其含有的活性成分性质不稳定，与光、空气以及有机物等接触后，这些成分会逐步分解，其氧化还原电位会逐步下降趋于正常，逐渐还原为普通的水，作用完毕排放后对环境无任何污染。
小宫山宽机等从老鼠、哺乳动物到人类志愿者进行了皮肤刺激性试验、皮肤过敏试验、口腔粘膜刺激试验、急性眼刺激试验、细胞毒性试验、染色体异常试验及微核试验等，发现所观测的各项指标均无显著变化，证明强酸性离子水无毒、副作用，无蓄积毒性，对皮肤无刺激，安全性很高；日本已于2001年批准将其列为食品加工添加物。对电生功能水进行腐蚀性试验的研究表明：电生功能水对不锈钢基本无腐蚀，对铜、铝及碳钢仅有低度腐蚀作用，使用安全可靠。由上述可见，电生功能水较一般的防腐杀菌剂具有更高的安全性。
电生功能水制取装置结构比较简单，在制取过程中无需大量的化学原料以及复杂的单元操作，与生产传统化学制剂相比成本低廉，有利于其在医疗卫生、食品加工尤其是农业生产等各项事业中推广应用
