碧水源每年将归属母公司净利润的10%投入技术研发，拥有强大的研发团队，已获得600余项专利技术 ，并于2009年 和2017年 两次获得国家科学技术进步奖二等奖。碧水源承担了国家科技重大专项水专项、863计划、国家科技支撑计划等国家课题，公司建有院士专家工作站、李锁定创新工作室 、国家工程技术中心 ，并先后与清华大学 、澳大利亚新南威尔士大学 等成立联合研发中心，落户中国境外火炬创新园区 ——澳大利亚新南威尔士大学火炬创新园 ，并牵头组建了膜生物反应器（MBR）产业技术创新战略联盟、水处理膜材料及装备产业技术创新战略联盟等。
