无附属物亚属

Subgen. Limniris（Tausch） Spach em. Rodion.

根状茎明显，根绳索状，不为纺锤形；花被管明显；外花被裂片倒卵形，基部逐渐过渡成狭窄的爪，中脉上无附属物，少数种生有单细胞的纤毛；蒴果大多无喙；种子梨形、半圆形或圆形，有时压扁，通常无翼或沿边缘有狭窄的翼状突起。

无附属物组

Sect. Limniris Tausch

花柱分裂大多至基部；花凋谢后花被管不残存在果实上。

紫苞鸢尾组

Sect. loniris Spach em. Rodion.

根状茎纤细；花茎上有1朵花；种子光亮，受潮后附属物变粘。

单苞鸢尾组

Sect. Ophioiris Y. T. Zhao

植株冬季常绿，夏季枯萎；根状茎粗壮，近地表处膨大成球形；苞片1枚。

琴瓣鸢尾亚属

Subgen. Xyridion（Tausch）Spach em. Rodion.

根的内皮层细胞沿辐射方向明显的伸长；外花被裂片提琴形；蒴果有喙和石条明显而突出的棱，每两条棱成对靠近；种子具膜质而膨起的种皮。

尼泊尔鸢尾亚属

Subgen. Nepalensis（Dykes）Lawr.

根状茎小，被毛发状的枯叶残留纤维；根肉质，肥厚，纺锤形。

野鸢尾亚属

Subgen. Pardanthopsis（Hance）Baker

花茎二歧状分枝；无或有花被管，外花被裂片上无附属物；种子有小翅。

鸡冠状附属物亚属

Subgen. Crossiris Spach

外花被裂片的中脉上有鸡冠状的附属物。

鸡冠状附属物组

Sect. Crossiris Spaeh

花茎有2-3（5-7）朵花；种子无或有白色的附属物。

小鸢尾组

Sect. Lophiris Tausch em. Rodion.

植株矮小；花茎上只有一朵花。

须毛状附属物亚属

Subgen. Iris

外花被裂片的中脉上有须毛状的附属物。

果实顶裂组

Sect. Iris

蒴果自顶端向下开裂为三瓣。

果实侧裂组

Sect. Hexapogon（Bunge）Baker em. Rodion.

蒴果从侧面开裂。