该物种由法国人让·巴普蒂斯·路易·皮埃尔和让·马里·安托万·德-兰尼桑在1886年命名。在不同国家和地区称谓有差异，如在日本、中国台湾等地就将交趾黄檀和巴里黄檀统称为紫檀，而在柬埔寨华人中也习惯将巴里黄檀叫做紫檀。越南和老挝人称之为“最高级别的木材”。
交趾黄檀用于中国人的家具制作始于明代。相传，郑和带着满船的绫罗珍宝远航弘扬国威、开拓海外贸易，然而换回来的货品重量太轻。为了避免偌大的船只在海面上风雨飘摇，郑和的船队在途经东南亚等国时，砍伐了当地的交趾黄檀作为垫船木来给货船压重。回到中国上岸后，这些垫船木大量被丢弃在岸边，成为无人问津的废材。后来，岸边的百姓发现这些压重的木材经过常年风吹雨打，材芯露出后却没有腐烂霉变，颜色好看，而且还有淡淡的酸香味，就用于家具制作。直至清朝，交趾黄檀成为宫廷、官商巨贾制作家具的重要木材，已是红木中珍稀名贵品种。
