播种幼苗期的管理：塔里木沙拐枣幼苗生长迅速，以6月中旬至8月中旬高生长最快，占年高生长量的60%左右，这时地下部分生长也快。因此，在幼苗生长的最初3个月内，每隔30-40天浅灌一次水，以后不再浇水。因幼苗怕涝，若灌水量较大或积水时间较长，常引起根腐病而成片死亡。在苗高4-6厘米，时，进行间苗及定苗工作，按5厘米的株距留苗。在整个苗期松土除草3次，以保持地表疏松。
扦插幼苗期的管理：扦抽后立即浇水。插后一周，补灌一次水，以满足插穗早期生根对水分之需求。整个苗期灌水2-3次，灌水间隔时间45天左右（视土壤墒情、天气状况而定），每次灌水量宜小。九月底幼苗地上部分生长停止。
