我国对膜生物反应器的研究虽然起步较晚，但发展速度很快。1991年，芩运华对膜生物反应器的应用进行了综述，介绍了MBR在日本的研究状况，这是我国学者对膜生物反应器做的较早的报道。随后，江成璋等人进行了中空纤维超滤膜在生物技术中的应用研究。1995年，樊耀波将MBR用于石油化工污水净化的研究，研制出一套实验室规模的好氧分离式MBR.
从1995年以来，我国对膜生物反应器污水处理技术的研究工作开始全面展开，多家科研院所进行了此方面的研究，清华大学、哈尔滨工业大学、中国科学院生态环境研究中心、天津大学、同济大学等对膜生物反应器的运行特性、膜通量的影响因素、膜污染的防止与清洗等方面做了大量细致的研究工作。2000年，顾平采用国产中空纤维膜对生活污水做了中试规模的MBR研究，结果表明：MBR工艺出水悬浮物为零，细菌总数优于饮用水标准，COD和氨氮的去除率都高于95%，出水可直接回用。2001年，张立秋等对一体式MBR处理生活污水的主要设计参数HRT、SRT等进行了理论推导，为实际工程设计提供了参考，并对膜堵塞机理进行了深入研究探讨，提出了膜内部生物堵塞的存在。
虽然，我国在MBR技术的研究探讨方面取得了显著的成绩，但是同日本、英国、美国等国家相比，我国的研究试验水平还比较落后，由于国产膜组件的种类较少，膜质量较差，寿命通常较短，因此在实际应用中存在一定的问题。虽然在我国膜生物反应器用于处理生活污水已有应用，但到目前为止，设计完善、运行良好的应用膜生物反应器的生活污水处理厂还未见报道。
