工程于1997年10月6日正式开工，2001年3月26日建成通车，比国家核批工期提前近7个月，同口径比较投资节省3亿多元，工程质量优良。2002年6月22日通过国家竣工验收，工程质量等级被评为优良，综合得分96.6分，获得了目前国内特大桥竣工验收评分的最高分。国内相关行业专家、交通部专家组和国家计委重大项目稽察办一致认为工程质量、进度、投资控制和建设管理水平，达到了国内领先，世界一流。
自2001年3月竣工通车以来，大大缓解了已有30多年历史的南京长江大桥的交通压力。南京长江二桥的建设资金由银行贷款和交通部、江苏省交通厅、南京市政府投资几部分组成，其中，银行贷款占总投资额的60%以上，因此南京二桥通行费的收取主要用于偿还银行贷款。
| 日期 | 进度 |
|---|---|
1992年1月23日 | 南京长江第二大桥正式开始项目前期筹建 |
1993年5月28日 | 国家计委批准项目建议书 |
1996年11月29日 | 南京长江第二大桥建设指挥部正式成立 |
1997年1月19日 | 南引线开工 |
1997年3月7日 | 国家计委批准可行性研究报告 |
1997年4月17日 | 交通部批准项目初步设计 |
1997年9月23日 | 国家计委批准项目开工报告 |
1997年10月6日 | 南京长江第二大桥正式开工 |
1997年12月14日 | 南汊大桥南主墩钢围堰着床 |
1998年1月7日 | 南汊大桥北主墩钢围堰着床 |
1998年1月13日 | 北汊大桥开工 |
1998年2月17日 | 南汊大桥南主墩钢围堰着岩 |
1998年3月11日 | 南汊大桥北主墩钢围堰着岩 |
1998年4月11日 | 南汊大桥南主墩钢围堰封底成功 |
1998年4月27日 | 南汊大桥北主墩钢围堰封底成功 |
1998年8月27日 | 南汊大桥南主墩桩基完成 |
1998年9月27日 | 南汊大桥北主墩桩基完成 |
1998年10月21日 | 南引线完成交工验收 |
1998年11月30日 | 南引线建成通车 |
1999年4月16日 | 南汊大桥索塔开始施工 |
1999年6月14日 | 北汊桥桩基础完成 |
1999年10月9日 | 南汊大桥南索塔封顶 |
1999年10月16日 | 南汊大桥北索塔封顶 |
1999年12月5日 | 南汊大桥开始钢箱梁浮吊 |
2000年2月20日 | 南汊大桥首对钢箱梁悬吊成功 |
2000年4月23日 | 北汊大桥下部完成，开始悬浇施工 |
2000年5月26日 | 南汊大桥南边跨合龙 |
2000年6月2日 | 南汊大桥北边跨合龙 |
2000年7月9日 | 南汊大桥主跨合龙 |
2000年8月21日 | 北汊大桥合龙 |
2000年9月22日 | 南汊大桥钢桥面环氧沥青混凝土铺装开始 |
2000年10月14日 | 南汊大桥钢桥面环氧沥青混凝土铺装完成 |
2000年11月25日 | 北汊大桥沥青混凝土铺装完成，二桥全线贯通 |
2001年1月12日 | 南汊主桥静载试验完成 |
2001年1月12日 | 南汊主桥动载试验完成 |
2001年1月13日 | 北汊主桥静载试验完成 |
2001年1月14日 | 北汊主桥动载试验完成 |
2001年3月18日 | 南京长江第二大桥通过交工验收 |
2001年3月26日 | 南京长江第二大桥建成通车 |
交通部在为南京二桥开通仪式发来的贺电中称赞:"二桥的工程质量和建设管理代表着我国公路基础设施建设的新水平，在我国桥梁史上树起了一座新的丰碑，是全国交通行业的光荣和骄傲。"
二桥在国内首次采用环氧沥青混凝土进行钢桥面铺装层施工，根据对环氧沥青混凝土1200万次高温、低温、常温疲劳试验的结果，南京二桥钢桥面环氧沥青混凝土质量达到世界一流水平。
