亚历克西睡莲是一年生或多年生水生草本植物；球根状根茎，直径2厘米。叶纸质，卵状椭圆形，略呈波浪状边缘，叶片10×15厘米，基部具深弯缺，约占叶片全长的1/3，裂片急尖，稍开展或几重合，全缘，上面光亮，下面带红色或紫色，两面皆无毛，具小点；叶柄长达60厘米。花直径3-5厘米；花梗细长；花萼基部四棱形，萼片革质，宽披针形或窄卵形，长2-3.5厘米，宿存。
花瓣白色，宽披针形，花朵高于水面30厘米以上。有令人愉悦的香气。花瓣数20至25，长5.5厘米，宽1.5厘米。有一个锋利的尖端。花萼4和5片，长度为6厘米。内轮不变成雄蕊，雄蕊数约150，比花瓣短，花药条形，长3-5毫米；柱头具5-8辐射线。
浆果球形，直径4.5厘米，为宿存萼片包裹；种子椭圆形，长1-2毫米，黑色，子房顶部红色。花期6-8月，果期8-10月。
