长果安息香仅分布于湖南石门和桑植以及湖北秭归四溪(厉恩华等, 2002), 由于数量稀少、分布区狭窄, 目前已处于濒危状态, 被列为国家二级保护植物(宋朝枢等, 1989; 傅立国, 1992)。长果安息香以湖南石门居群数量为最大(大约600株),主要分布在壶瓶山自然保护区的江坪景关门、恒长湾、土湾、南坪杨家湾。此外, 在药圃河等处沿溪流也有零星分布, 海拔高度为200–1200 m。长果安息香通常混生于常绿阔叶林和常绿、落叶阔叶混交林中,主要伴生树种有:黑壳楠(Lindera megaphylla)、红果黄肉楠(Actinodaphnecupularis)、木荷、青冈栎、栲树等。景关门和杨家湾的居群较大, 林下有较多的幼苗; 其他几个居群都较小, 都不超过60株。长果安息香大多分布在保护区的核心区外, 而且大部分分布在林地边缘; 而这些分布区内许多山林是私有的, 当地居民主要依靠经营及加工林木为生, 加上外地商人时常到当地收购兰草等资源, 造成分布区周围森林植被破坏情况比较严重(叶其刚等, 1996)。另外, 长果安息香的内果皮木质化, 种子萌芽力极低,在自然条件下只有通过流水的冲刷使内果皮磨损才能发芽。环境压力以及自身的种子生理特性导致其居群大小不断减小(调查发现总量不超过700株), 因此急需加以保护。