睡莲主要采取分株繁殖。耐寒种通常在早春发芽前3-4月进行分株，不耐寒种对气温和水温的要求高，因此要到5月中旬前后才能进行分株。分株时先将根茎挖出，挑选有饱满新芽的根茎，切成8-10厘米长的根段，每根段至少带1个芽，然后进行栽植。顶芽朝上埋入表土中，覆土的深度以植株芽眼与土面相平为宜，每盆栽5-7段。栽好后，稍晒太阳，方可注入浅水，以利于保持水温，但灌水不宜过深，否则会影响发芽。待气温升高，新芽萌动时再加深水位。放置在通风良好、阳光充足处养护，栽培水深20-40厘米，夏季水位可以适当加深，高温季节要注意保持盆水的清洁。

睡莲也可采用播种繁殖，即在花开后转入水中，果实成熟前，用纱布袋将花包上，以便果实破裂后种子落入袋内。种子采收后，仍须在水中贮存，如干藏将失去发芽能力。在3-4月进行播种，盆土用肥沃的粘质壤土，盛土不宜过满，宜离盆口5-6厘米，播入种子后覆土1厘米，压紧浸入水中，水面高出盆土3-4厘米，盆土上加盖玻璃，放在向阳温暖处，以提高盆内温度。播种温度在25-30℃为宜，经半个月左右发芽，第二年即可开花。