目前全世界各海域的海草共有12属，我国共有9属，海南共有4属。大面积分布的连片海草称为海草床。从2002年起，中科院南海海洋研究所、日本北海道大学等单位的研究人员，对省的海草床资源生态系统进行了调查，调查发现，海南岛东部从文昌至三亚、西部从澄迈到东方的近岸海域都属海草分布区，具体分布情况如下:

第一、东部海域有成片的海草床。在海南的东部海域，可见到成片的海草，构成良好的海草床生态，海草床分布面积3~5平方公里，有的海草高达1米多，主要海草种类为喜盐草、海菖蒲、泰莱草、二药藻等4属。如文昌市高隆湾、琼海市龙湾、陵水县新村港和黎安港、三亚市三亚湾和大东海等海域都有大面积的海草床分布。

第二、西部海域基本没有海草床。在海南的西部海域，按经纬度、气候、地形等判断，应该有大面积的海草床分布。但研究人员实地调查发现，临高县、昌江县和东方市等海域的海草人为破坏较为严重，已基本不能成为海草床。