1 作为分析手段使用

分为单独使用和与其他分析设备配套使用两种形式。

单独使用的应用范围已经十分广泛，是常规的仪器分析手段，相关的国家标准也很多，2015年正在执行的已经超过600项。

比如:

GB/T 30388-2013 辣椒及其油树脂 总辣椒碱含量的测定 高效液相色谱法

GB/T 25224.2-2010 动植物油脂 植物油中豆甾二烯的测定 第2部分:高效液相色谱法

GB/T 17528-2009 胡椒碱含量的测定 高效液相色谱法

配套使用主要是与质谱等设备联用，能够有效的确定混合物样品或者是未知物样品的组分。

比如:

GB/T 29664-2013 化妆品中维生素B3(烟酸、烟酰胺)的测定 高效液相色谱法和高效液相色谱串联质谱法

GB/T 23217-2008 水产品中河豚毒素的测定 液相色谱-荧光检测法

2 作为微量分离手段使用，详见"制备色谱"词条

称之为高效液相制备色谱。在将物质分离后进行分别收集，实现微量物质的分离。

这在高端化学品，比如手性药物中间体的制备中，非常常见。