土壤次生盐渍化的形成很大程度上给地下水带来诸多影响。由于地下水超采使
地下水位持续下降，沿渤海、黄海的沙质和基岩裂隙海岸地带，发生海水入侵，在有咸水分布的地区出现咸水边界向淡水区移动。例如，山东沿海地区由于地下水位大幅度下降，涞州湾形成面积为11，400km2的地下水位下降漏斗，其中地下水位在海平面以下的面积为2400km2，1988年漏斗中心地下水位在海平面以下20m，造成涞州湾海水入侵地下水含水层，海水入侵的面积达730.7km2。山东省的烟台、威海、和青岛市也发生了海水入侵。地下水位的下降也造成辽宁省大连市、锦州、锦西、营口市，和河北秦皇岛市的海水入侵和水质恶化。1992年辽宁省海水入侵面积达434km2，秦皇岛市达55.4km2。在广西省北海市的海城区和涠州岛都曾由于长期超采地下水引起海水入侵，造成水质恶化。
