（1）可能卷入结晶器保护渣，使铸坯夹杂物含量增加。M - EMS 搅拌能改善铸坯质量，搅拌强度越大，效果越明显，但搅拌强度过大，会引起保护渣的卷入，反而使夹杂物含量增加。同时，电磁搅拌还直接影响结晶器液面的检测效果，目前普遍采取降低搅拌线圈安装位置来解决这一问题，但使M-EMS 的冶金作用受到了限制。
（2）M-EMS 搅拌难以改善高碳钢的中心碳偏析。图1为有无电磁搅拌浇铸含碳0.61%的弹簧钢大方坯的中心碳偏析比较。M-EMS搅拌虽然使中心偏析的偏差值和峰值大大降低，但中心偏析的平均值变化不大。因此，仅采用M-EMS搅拌难以使碳的中心偏析得到根本改善。
对于芯部质量特别是中心碳偏析要求较高的钢种，如钢轨钢、轴承钢、弹簧钢、钢帘线钢等，单一的结晶器电磁搅拌工艺难以满足芯部质量的严格要求，需要采用复合搅拌工艺。目前，在高碳钢大方坯连铸中应用最多的是结晶器 凝固末端电磁搅拌(M F-EMS) 。
