仙游抽水蓄能电站利用木兰溪源头两条平行支流———大济溪和溪口溪筑坝，形成上、下水库；工程枢纽建筑物主要包括上水库、输水系统、地下厂房、下水库和开关站等。

上水库：上水库位于西苑乡广桥村木兰溪源头支流大济溪上，主要施工项目为主坝、虎歧隔副坝、湾尾副坝、库周防护/ 防渗、拦渣坝、坝顶公路及库盆清理等。主坝为钢筋混凝土面板堆石坝，坝顶高程747.6m，坝轴线长340.00m，最大坝高72.6m；虎歧隔副坝为分区土石坝，坝轴线长70m，最大坝高15m；湾尾副坝亦为分区土石坝，坝顶全长24m，最大坝高3m。

输水系统：输水系统由引水系统和尾水系统组成。引水系统采用一洞二机的布置型式，由上库进/出水口、上库事故检修闸门井、引水隧洞上平段、上斜井段、中平段、下斜井段、下平段、引水岔管、高压钢衬支管等建筑物组成。其中单条引水隧洞总长约1147.8m。尾水系统亦采用一洞二机的布置型式，由尾水支管、尾水闸门洞、尾水岔管、尾水调压室、尾水隧洞、下库事故检修闸门井和下库进/ 出水口等组成。单条尾水隧洞长约1104.4m。

地下厂房系统：地下厂房系统由主、副厂房洞、主变洞、母线洞、500kV电缆出线洞、进厂交通洞、主变排风洞、厂房排水廊道、通风兼安全洞及地面开关站等建筑物组成。

下水库：下库坝址位于西苑乡半岭村上游1km 处溪口溪峡谷中，河谷呈“V”字型，主要施工项目包括大坝、溢洪道、导流放水洞改建、库盆清理及库岸防护等。大坝为钢筋混凝土面板堆石坝，坝顶高程299.9m，坝轴线长277m，最大坝高74.9m；溢洪道长约410m；导流放水洞长442.15m。