全线列车各站停车全区间运行。

2010年3月13日更改时刻表时除了早晨的班次和末班车之外全线列车1小时2班。

2010年12月4日再次更改时刻表全线列车不均等时间间隔运行，1小时运行2~3班。

2013年11月21日更改时刻表，除了早高峰之外1小时运行1班，中午12时没有班次。列车会在笠上黑生站进行列车交换，但是只在16时~19时之间进行。由于线路车库位于仲之町站，所以早6时和夜20时有铫子站~仲之町站间的区间列车，但是这两班次在本次调图之后被取消。

虽然是单人运行，但是铫子站~笠上黑生站间为了收取运费，乘务员会经常乘坐。另外虽然线路规模不大，但车站工作人员配置站也比较多，与单独运行的其他铁路线路相比，使用运费箱收取运费的情况比较少。

4月下旬~10月上旬的周日和节假日中，会使用自国铁ワム80000型货车厢改造而来的开放式旅游车厢“澪杉菜”号每天往返运行1班。因为是在电力列车牵引下运行，所以在外川站会进行电力列车换向操作，但是铫子站无法进行相同操作，所以在仲之町站，会向列车最后在追加一节电力列车，在铫子站接待完客人后再回到仲之町站将之前的头车断开。

每年1月1日JR东日本都会以第一天的游客为对象，开行东京站 · 成田站~铫子站的临时特急“犬吠第一天的日出”号和快速“铫子第一天的日出”号，而铫子电气铁道则为迎合这一客流，为了前往犬吠埼的乘客，将除夕末班车提前、首班车提前、使早上时段的犬吠站~外川站间的停运时间组成了特别时刻表。之前线路列车会彻夜运行。2100433B