大连理工大学建设工程学部的前身为土木工程系(1949~1955),1955年~1985年为水利工程系,1985年~1996年扩建为土木工程系,1996年~2002年为土木建筑学院,2002年6月~2009年9月为土木水利学院,2009年9月组建成建设工程学部。
1986年,由国家计委批准筹建海岸和近海工程国家重点实验室。
1999年,大连理工大学在土木工程专业分出工程管理专业方向。
2003年,大连理工大学成立工程管理教研室,独立招收工程管理专业本科生。
2009年9月,大连理工大学组建建设工程学部,由原大连理工大学土木水利学院水利工程一级学科相关的8个研究所组建大连理工大学建设工程学部水利工程学院,原工程管理教研室调整为工程管理研究所,设置于建设工程学部土木工程学院之内。
2011年11月,大连理工大学以工程管理研究所为基础,吸引外部人才和整合校内资源组建建设管理系。