该系拥有的土木工程实验中心，具有交通部乙级资质；是山东省普通高校实验教学示范中心。中心设有建材、土工、路面、桥梁、测量、力学、水力、地质、港口、项目管理、地理信息等10几个实验室，使用面积约有10000平方米，设备总值约4000多万元，拥有多台国内外先进的仪器和设备。其中，路面结构实验室、桥梁检测与加固实验室、港口航道实验室被教育部列为“行业特色实验室”，实行中央与地方共建。
该系还设有公路环境与工程实验研究中心，路桥设计研究院、交通材料研究所、岩土与基础工程研究所、桥梁检测与加固研究所，项目管理研究所。土木工程系与山东省路桥集团有限公司、山东省交通规划设计院、山东省交通科研所、各地市公路局等建设单位建立了“产、学、研”合作基地，为教学和科研提供了有力保障。
