办公室（宣传教育处）。负责机关日常运转，承担机关文电、会务、机要保密、档案、政务公开、信访、接待、后勤、安全等工作；承担机关政务协调和督办工作；组织开展和指导全市生态环境信息和数据管理；研究拟订并组织实施生态环境保护宣传教育纲要；组织开展生态文明建设和环境友好型社会建设的宣传教育工作；承担局新闻审核和发布；负责指导生态环境舆情收集、研判、应对工作，推动社会组织和公众参与生态环境保护。
（二）综合业务处（生态文明建设处）。组织编制全市生态环境规划、生态环境功能区划，协调和审核生态环境专项规划；承担生态环境统计、污染源普查和生态环境形势研究分析工作；承担污染物排放总量控制综合协调和管理工作；监督检查各地污染物减排任务完成情况；拟订生态环境保护年度目标；协调全市生态文明建设工作，组织编制生态文明建设规划，开展生态文明建设考核和评价；配合上级有关部门开展生态环境监察和督察工作；负责与中央、省级生态环境保护督察对接组织协调工作，承担中央、省生态环境保护督察交办问题线索移交移送及其后续相关协调工作；承担市生态文明建设领导小组办公室和市生态环境保护委员会办公室的日常工作。
（三）政策法规和科技处（生态环境执法监督处）。拟订生态环境的地方性法规、规章草案，承担规范性文件的合法性审查工作；承担行政执法监督、行政复议、行政应诉等工作；拟订地方生态环境标准、基准和技术规范；负责生态环境损害赔偿相关工作；承担生态环境科技工作；参与拟订全市生态环境科技发展规划与计划；管理生态环境科研项目和成果；组织环境保护新技术的示范与推广；参与指导和推动循环经济与生态环境产业发展工作；监督生态环境政策、规划、法规、标准的执行；指导全市生态环境保护综合执法队伍建设；负责依法赋予全市生态环境执法机构实施现场检查、行政处罚、行政强制的条件和手段。
（四）财务和审计处。管理市级环保专项资金和项目，提出市生态环境领域固定资产投资规模和方向、财政性资金安排的建议和资金使用年度计划并组织检查验收；承担机关、派出机构和直属单位财务、国有资产管理、内部审计工作。
（五）自然生态保护处。组织起草生态保护规划；开展全市生态状况评估，指导生态示范创建工作；承担自然保护地、生态保护红线相关监督管理工作；组织开展生物多样性保护、生物遗传资源保护、生物安全管理工作。
（六）水生态环境处。负责全市地表水生态环境监督管理；承担流域水环境保护职责；拟订并组织实施地表水污染防治管理制度；组织编制地表水（环境）功能区划、流域水生态环境保护规划；监督管理饮用水水源地生态环境保护工作，负责入河排污口监督管理。
（七）大气环境处（应对气候变化处）。负责全市大气、噪声、光、化石能源等污染防治的监督管理；建立对各县（市）区大气环境质量改善目标落实情况考核制度；组织实施区域大气污染联防联控协作机制；组织拟订重污染天气应对政策措施；建立并组织实施机动车环保监管制度；组织协调大气面源污染防治工作；综合分析气候变化对我市经济社会发展的影响；组织实施国家、省和市应对气候变化和推进绿色低碳发展的战略、规划和政策；承担全市生态环境对外合作与交流的工作；组织开展有关生态环境国际条约的履约工作；承担市有关应对气候变化和减排方面的具体工作。
土壤生态环境处（固体废物和化学品处）。负责全市土壤、固体废物、化学品、重金属等污染防治和土壤生态保护的监督管理；拟订并组织实施相关污染防治政策、规划和计划；负责监督防止地下水污染；指导农村生态环境保护；监督指导农业面源污染治理工作；指导农村环境综合整治和生态农业建设工作等。
核与辐射环境管理处。承担全市核与辐射环境安全管理工作；拟订并组织实施核技术应用、电磁辐射、放射性物质运输和伴有放射性矿场资源开发利用中的污染防治制度；负责废旧放射源和放射性废物管理；负责辐射事故应急工作，参与核事故应急；配合上级生态环境部门对市内核设施安全、核材料的管制和民用核安全设备的设计、制造、安装实施监督管理。
行政审批处。负责本部门相关行政审批工作，并限时办结；承担局行政审批改革任务；组织规划环境影响评价、政策环境影响评价等审查工作；组织全市排污许可综合协调和管理工作，拟订生态环境准入清单并组织实施。
生态环境监测和信息处。组织开展和指导全市生态环境监测管理工作；组织开展全市生态环境质量监测管理工作；会同有关部门统一规划全市生态环境质量监测站点设置；调查评估全市生态环境质量状况并进行预测预警，参与发布全市生态环境状况公报的有关工作；承担全市生态环境监测网建设和管理工作；负责对全市生态环境执法监测、污染源监督性监测、应急监测的监督管理；指导全市环境监测机构建设，负责对社会环境监测机构和运营维护机构的监督管理；建设和管理全市生态环境信息网，组织全市污染防治综合监管平台建设。
组织人事处。负责机关、派出机构和直属单位的干部人事、机构编制、劳动工资等工作；负责机关和直属单位离退休人员工作；配合省市有关部门做好全市生态环境系统领导干部双重管理有关工作。
（十三）机关党委。负责机关、主城区（含经济技术开发区）派出机构和直属单位党群工作；加强全市生态环境系统党建和党风廉政建设；指导各县（市）、铜山区、贾汪区生态环境局加强政治思想、作风纪律和制度建设。
