公司实行权责分明、管理科学、激励和约束相结合的内部管理体制，目前下设十一个部门，包括七部、一室、三个分场，共有职工293名。 2002年12月29日，中国华电集团公司成立，山东国际电源开发股份有限公司移交中国华电集团公司管理，山东章丘发电有限责任公司因此成为中国华电的控股企业，公司的生产经营由山东国际电源开发股份有限公司负责管理。面对新形势，新任务，公司将在中国华电集团公司和山东国际电源开发股份有限公司的正确领导下，秉承“规范高效，求实创新”的经营理念，加快改革与发展，增强市场竞争力，加速向一流发电企业迈进，实现公司可持续发展的奋斗目标。
