武汉大学水利水电学院的历史可以追溯到1952年成立的武汉大学水利学院。上世纪50年代初，全国高校院系调整时，先后将湖南大学、华南工学院、天津大学等十余所院校水利专业的师生和设备调入武汉大学。1954年12月，水利学院从武汉大学剥离，成为以水利类专业为主体的独立工科院校。2000年8月，新的武汉大学成立后，原武汉水利电力大学的水利工程系、水力发电工程系、水资源与河流工程系及水利水电科学研究所又重新整合组成水利水电学院。经过五十多年的建设与发展，学院现已成为综合实力雄厚、专业特色鲜明、享誉国内外的水利水电高级人才培养的摇篮和科学研究的重要基地。

学院现有水利水电工程、水文与水资源工程、港口海岸及治河工程和农业水利工程4个本科专业，有水利工程一级学科博士授予权、工程硕士授予

权和 博士后流动站，有博士学位授权学科点7个、硕士学位授权学科点8个，形成了完整的水利专业人才培养体系。有水利工程国家一级重点学科和水资源与水电工程科学国家重点实验室，学科优势明显。现有教师159人，其中中国工程院院士3人，教授62人，副教授62人。

2000年以前，实验室分散在各系和教研室，其运行管理基本上依附于相关的教研室，人员多，规模小，场地分散。新武汉大学成立后，为了加强实验教学和实验室管理，在全校进行了实验室管理体制改革。2001年10月，按照学校的统一部署，对相关实验室进行了整合，成立了“武汉大学水利水电工程实验教学中心”。实验室由过去依附于教研室变为独立的教学实体，实验教学中心主任和副主任由学校任命。中心实行校院两级管理。