在自然界中的作用主要表现在以下几个方面。

1.苔藓植物是自然界的拓荒者

许多苔藓植物都能够分泌一种液体，这种液体可以缓慢地溶解岩石表面，加速岩石的风化，促成土壤的形成，所以苔藓植物也是其他植物生长的开路先锋。　

2.苔藓植物能够促使沼泽陆地化

泥炭藓、湿原藓等极耐水湿的苔藓植物，在湖泊和沼泽地带生长繁殖，它们的衰老的植物体或植物体的下部，逐渐死亡和腐烂，并沉降到水底，时间久了，植物遗体就会越积越多，从而使苔藓植物不断地向湖泊和沼泽的中心发展，湖泊和沼泽的净水面积不断地缩小，湖底逐渐抬高，最后，湖泊和沼泽就变成了陆地。

3.苔藓植物的指示作用

许多种苔藓植物可以作为土壤酸碱度的指示植物，像生长着白发藓、大金发藓的土壤是酸性的土壤；生长着墙藓的土壤是碱性土壤。近年来，人们把苔藓植物当做大气污染的监测植物。例如，尖叶提灯藓和鳞叶藓对大气中的SO2特别敏感。

4.苔藓植物具有保持水土的作用

群集生长和垫状生长的苔藓植物，植株之间的空隙很多。因此，它们具有良好的保持土壤和贮蓄水分的作用。有些苔藓植物的本身，还有贮藏大量水分的功能，像泥炭藓叶中大型的贮水细胞，可以吸收高达本身重量20倍的水分。

5.用作肥料及燃料

泥炭藓(Peat mosses)可以用作肥料有可以增加沙土的吸水性，还也可以晒干作为燃料，用来发电。

6.药用价值

有些种类的泥炭藓还可做草药，能清热消肿，泥炭酚可治皮肤病。