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自动化工程学院已形成了以电气自动化技术专业为龙头,应用电子技术专业、楼宇智能化工程技术、工业机器人技术、港口物流及自动化为支撑的智能制造自动化专业群,辐射服务海西电子信息行业及自动化相关企业。电气自动化专业为福建省高等职业教育示范专业,该专业获“福建省高职专业建设质量评价”第二名。