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四川牡丹生于干旱谷地,分布区气候(以马尔康为例)年平均温度8.3℃,7月份平均温度16.1℃,1月份平均温度-0.3℃,极端最高气温31.0℃,极端最低温-16.6℃,年降雨量786毫米,其中92%集中在5~9月,其余时间十分干冷,相对湿度为34~82%,平均61%,11月至3月有时几乎达到零。
土壤为山地黄壤,弱酸性,pH值约6.4,母岩为花岗岩。阳性植物,喜生于多刺灌丛中,多见于东南坡,东坡较少,偶见于北坡和西南坡。